Available Software by Toolchain

Contents

1. Software by Toolchain

Software by Toolchain

This lists software packages by toolchain on cluster zt.

All packages available on the Zaratan cluster

All packages (unsorted by field)

This section list all installed research software, unsorted by field of research/category/etc.

All packages (unsorted by field)

Package Name	Availibility by Toolchain
	generic	gcc/2020	gcc/2021	gcc/2023	gcc-amd/2020	gcc-amd/2021	gcc-amd/2023	aocc/2021	intel/2021	oneapi/2021	nvhpc/2023
abaqus	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
adapterremoval	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
adios2	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
afni	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
alphafold	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
amber	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
amdblis	no	no	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
amdfftw	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
amdlibflame	no	no	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
amdlibm	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
amdscalapack	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
angsd	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
ansys	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
ansys-em	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
aocc	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
aocl-sparse	no	no	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
armadillo	no	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
arpack-ng	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
bamtools	no	yes	no	yes	yes	no	yes	no	no	no	no
bcftools	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
bedtools2	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
binutils	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
blast-plus	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
bml	no	yes	no	yes	no	no	no	no	no	no	no
boost	no	yes	no	yes	yes	no	no	yes	no	no	no
bowtie	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
bowtie2	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
bwa	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
bzip2	no	no	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
c-blosc	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no
caffe	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no
cdo	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
cfitsio	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
cfour	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
cgal	no	yes	no	yes	no	no	no	no	no	no	no
cgns	no	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no
charm4py	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
charmm	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
charmpp	no	yes	yes	no	yes	yes	no	yes	no	no	no
cmake	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no
cmdstan	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
cminpack	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no
colmap	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
comsol	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
coreutils-progress-viewer	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
cosma	no	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
cp2k	no	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
cube	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
cubelib	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
cubew	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
cuda	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no
cuda-compatibility	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
cudnn	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no
cupy	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
curl	no	yes	no	yes	yes	no	yes	no	no	no	no
cython	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
dmtcp	no	no	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
dplr	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
dyninst	no	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no
eccodes	no	yes	no	yes	yes	no	yes	no	no	no	no
edem	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
eigen	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no	no
elpa	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
embree	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
envi	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
esmf	no	yes	yes	yes	no	yes	no	no	no	no	no
exonerate	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
fastqc	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
fds	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
ffmpeg	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
fftw	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no	no
freebayes	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
freesurfer	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
freetype	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no
fribidi	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
fun3d	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
gatk	no	no	yes	yes	no	no	yes	no	no	no	no
gaussian	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
gcc	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
gdal	no	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
geos	no	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no
git-lfs	no	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no
gloo	no	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no
gmp	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
gnuplot	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
go	no	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no
grads	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
graphviz	no	no	yes	yes	no	no	yes	no	no	no	no
gromacs	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
gsl	no	yes	no	yes	no	no	no	yes	no	no	no
gssha	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
gurobi	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
h5utils	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
harfbuzz	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
hdf-eos2	no	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no
hdf-eos5	no	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no
hdf4	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
hdf5	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no
hemocell	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
hip	no	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no
hmmer	no	yes	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
hpcc	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
hpctoolkit	no	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
hpl	no	no	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
hpx	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
htslib	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
hypre	no	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
icu4c	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
igv	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
impute2	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
intel	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
intel-advisor	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
intel-dal	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
intel-dnn	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
intel-dpl	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
intel-inspector	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
intel-ipp	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
intel-ippcp	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
intel-mkl	no	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no
intel-mpi	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
intel-mpi-benchmarks	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
intel-tbb	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no
intel-vpl	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
intel-vtune	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
ioapi	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
ior	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
jags	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
jasper	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
jellyfish	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
json-c	no	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no
jsoncpp	no	yes	no	yes	yes	no	yes	no	no	no	no
julia	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
jupyter	no	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no
kahip	no	yes	no	yes	yes	no	yes	no	no	no	no
kallisto	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
lammps	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
latte	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no
libiconv	no	no	no	yes	no	no	yes	yes	no	no	no
libint	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
libpng	no	no	yes	yes	no	yes	yes	yes	no	no	no
libtiff	no	yes	no	yes	yes	no	yes	no	no	no	no
libvdwxc	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no
libxsmm	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no	no
libzmq	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
llvm	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
lumerical	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
lz4	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no
magics	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
magma	no	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
magma-computer-algebra	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
materials-studio	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
mathematica	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
matio	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no	no
matlab	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
mercurial	no	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no
mesa	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
metis	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
mgridgen	no	no	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
mothur	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
mpfr	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
mt-metis	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
mumps	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
namd	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
nccl	no	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no
ncl	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
nco	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
ncview	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
netcdf	no	yes	no	yes	yes	no	yes	no	no	no	no
netcdf-cxx	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
netcdf-fortran	no	yes	no	yes	yes	no	yes	no	no	no	no
netlogo	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
nvhpc	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	yes
nvmpi	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
oneapi	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
openblas	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
opencv	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
openfoam	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
openjdk	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no
openmm	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
openmpi	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no
openstructure	no	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no
orca	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
osu-micro-benchmarks	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no
parallel	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
parallel-netcdf	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no
paraview	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
paraview-headless	no	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
pari-gp	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
parmetis	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
parmgridgen	no	no	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
perl	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no
petsc	no	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
pexsi	no	yes	no	yes	no	no	no	no	no	no	no
pfft	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no
pgplot	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
picard	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
plink	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
plplot	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
plumed	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
popoolation2	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
povray	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
proj	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
pyray	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
python	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
pytorch	no	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
qmd-progress	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no
qt	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
quantum-espresso	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
r	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
rclone	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
rdma-core	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
rocky	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
rust	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
samtools	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
scalapack	no	yes	no	yes	no	no	no	no	no	no	no
scons	no	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no	no
scorep	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
scotch	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
shapeit4	no	no	yes	yes	no	yes	no	no	no	no	no
silo	no	yes	no	yes	yes	no	yes	no	no	no	no
singularity	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
sirius	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no
slepc	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
smokeview	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
snpeff	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
sox	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
spfft	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
spglib	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
sqlite	no	no	no	yes	no	no	yes	yes	no	no	no
stacks	no	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no
star-ccm	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
suite-sparse	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
superlu	no	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
superlu-dist	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
superlu-mt	no	no	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
swig	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
sz	no	yes	yes	yes	no	no	yes	no	no	no	no
tecplot360	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
tensorflow	no	yes	yes	yes	no	no	no	no	no	no	no
toolchain/aocc	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
toolchain/gcc	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
toolchain/intel	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
tophat	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
trilinos	no	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no
udunits	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
ufs-weather-model	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
umd-examples/hello-umd	no	no	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
us3d	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no
usearch	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no	no
vasp	no	no	no	no	no	yes	no	no	yes	no	no
vcftools	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no
virtualgl	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
visit	no	no	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no
vmd	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no
voropp	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
vtk	no	yes	yes	yes	no	no	yes	no	no	no	no
wannier90	no	yes	no	no	no	no	no	yes	no	no	no
xerces-c	no	yes	yes	yes	yes	yes	yes	no	no	no	no
xssp	no	yes	no	no	yes	no	no	no	no	no	no
xz	no	no	no	yes	no	no	yes	yes	no	no	no
zfp	no	yes	no	no	no	no	no	no	no	no	no
zlib	no	no	no	yes	no	no	yes	yes	no	no	no
zoltan	no	yes	no	yes	yes	no	yes	no	no	no	no
zstd	no	yes	no	yes	yes	no	yes	yes	no	no	no

Back to Top